کاربرد پروتئومیکس در باکتری‌شناسی پزشکی با تأکید بر آنالیز پروتئومی پست بیوتیک ها

نوع مقاله : مقاله مروری

نویسندگان

1 مرکز تحقیقات کاربردی علوم دارویی، دانشگاه علوم پزشکی تبریز، تبریز، ایران

2 گروه میکروب شناسی پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ارومیه، ارومیه، ایران

3 گروه میکروب شناسی پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تبریز، تبریز، ایران

4 گروه علوم و صنایع غذایی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد تبریز، تبریز، ایران

5 گروه علوم و صنایع غذایی، انستیتو تحقیقات تغذیه ای و صنایع غذایی کشور، دانشکده علوم تغذیه و صنایع غذایی، دانشگاه علوم پزشکی شهید

6 مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی، دانشگاه علوم پزشکی تبریز، تبریز، ایران

چکیده

مقدمه: ساختار باکتری‌ها متشکل از ماکرومولکول های مختلفی ازجمله پروتئین‌ها، پلی ساکاریدها، فسفولیپیدها و اسیدهای نوکلئیک می‌باشد که علاوه بر ایفای نقش در تشکیل ساختمان آن‌ها، نقش اساسی در حفظ حیات و بیماری‌زایی آن‌ دارند. هدف از این مطالعه، بررسی کاربرد پروتئومیکس در تجزیه و تحلیل نمایه پروتئومی باکتریایی و پست بیوتیک های تولیدی می باشد.

روش کار: در این مطالعه مروری داده های مربوطه با جستجوی کلید واژه های «پروبیوتیک، پست بیوتیک، پروتئوم، پروتئومیکس، بیوفیلم، مقاومت آنتی بیوتیکی» در پایگاه های اطلاعاتی وب آو ساینس، پاب مد، مدلاین و اسکاپوس گردآوری شده است، تمامی مقالات مرتبط با مطالعات تجربی وارد مطالعه شده و مقالاتی که حاوی متن کامل نبودند از مطالعه خارج شدند.

نتایج: برای مطالعه ماکرومولکول های میکروبی علاوه بر روش‌های ژنومیکی، روش‌های پروتئومیکی نیز وجود دارند که اطلاعاتی در مورد پروتئین‌های ساختاری و عملکردی باکتری‌ها ارائه می‌دهند.در محدوده مطالعات پروتئومیکسی باکتریایی،علاوه بر باکتری‌های بیماری‌زا، باکتری‌های پروبیوتیکی نیز مطرح می باشند که به‌عنوان بخشی از ساختار این میکروارگانیسم‌ها و همچنین در اثر فعالیت متابولیکی آن‌ها، ترکیباتی موسوم به پست بیوتیک تولید می‌گردند که مسئول اثرات مفید آن‌ها بوده ودارای خواص مختلفی از جمله اثرات ضدمیکروبی،ضد التهابی و تعدیل ‌کنندگی سیستم ایمنی می باشند.

نتیجه گیری: بهره گیری از پروتئومیکس کاربردی در زمینه تجزیه و تحلیل نمایه پروتئومی باکتری ها از جمله پروبیوتیک ها می تواند رویکردی نوین در جهت شناخت همه جانبه متابولیت های پست بیوتیک عنوان گردد که به مراتب زمینه ساز غنی سازی ماتریکس مواد غذایی جهت توسعه غذاهای فراسودمند برای اهداف سلامت بخشی می باشد.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


عنوان مقاله [English]

Application of Proteomics in Medical Bacteriology with Emphasis on Proteomic Analysis of Postbiotics

نویسندگان [English]

  • Mahdi Asghari Ozma 1
  • Masoud Lahouty 2
  • Niloofar Fallahi Alileh 1
  • Sina Mahdavi 3
  • Masoud Asghari Ozma 4
  • Javad Nezhadi 3
  • Amin Abbasi 5
  • Mohammad Asgharzadeh 6
1 Drug Applied Research Center, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran
2 Department of Microbiology, Urmia University of Medical Sciences, Urmia, Iran
3 Department of Microbiology, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran
4 Department of Food Science and Technology, Islamic Azad University, Tabriz branch, Tabriz, Iran
5 Department of Food Science and Technology, National Nutrition and Food Technology Research Institute, Faculty of Nutrition Science and Food Technology, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran
6 Biotechnology Research Center, Tabriz University of Medical Sciences, Tabriz, Iran
چکیده [English]

Introduction
The structure of bacteria consists of various macromolecules such as proteins, polysaccharides, phospholipids and nucleic acids, which, in addition to their role in forming their structure, play an essential role in maintaining their viability and pathogenicity. This study aimed to investigate the application of proteomics in the analysis of proteomic profiles of bacteria and their derived postbiotics.

Material and Method
In this review study, relevant data were collected by searching for the keywords "probiotics, postbiotics, proteome, proteomics, biofilm, antibiotic resistance" in the Web of Science, PubMed, Medline, and Scopus databases. All articles related to experimental studies were included in the study and articles that did not contain the full text were excluded.

Results
To study microbial macromolecules, in addition to genomic methods, there are also proteomic methods that provide information about the structural and functional proteins of bacteria. In the scope of bacterial proteomics studies, in addition to pathogenic bacteria, probiotic bacteria are also mentioned, which are part of the structure of this Microorganisms, as well as due to their metabolic activity, produce compounds known as postbiotics, which are responsible for their beneficial effects and have various properties, including antimicrobial, anti-inflammatory and immune system modulating effects.

Conclusion
Utilizing applied proteomics in the field of proteomic profile analysis of bacteria, particularly probiotics can be considered a new approach towards the comprehensive knowledge of postbiotic metabolites, which is the basis for the enrichment of the food matrices for the development of functional foods for health-promoting objectives.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Bacteriology
  • Postbiotic
  • Probiotic
  • Proteome
  • Proteomics